農業外來入侵物種普查是農業農村部會同有關部門建立外來入侵物種普查制度，每十年組織開展一次全國普查，掌握我國外來入侵物種的種類數量、分布范圍、危害程度等情況，并將普查成果納入國土空間基礎信息平臺和自然資源“一張圖”。2021年4月施行的《中華人民共和國生物安全法》對防范外來物種入侵，加強對外來入侵物種的調查、監測等工作作出了明確規定。 實施外來入侵物種普查，是國家明確要求開展的基礎性工作。農業農村部門負責農田、果園、漁業水域的外來入侵物種普查。

農業外來入侵物種普查 面上調查技術規程（試行）
農業外來入侵植物調查與標本制作技術規定
農作物外來入侵病蟲害調查與標本制作技術規定
外來入侵水生動物調查與標本制作技術規定
農業外來入侵物種普查質量控制技術規定

農業外來入侵物種普查的調查對象包括農業外來入侵植物、農作物外來入侵病蟲害和外來入侵水生動物 3 大類。