菌種鑒定是什么
發布時間:2021-03-18
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一、菌種鑒定目的
通過形態特征、理化特性、遺傳進化角度等闡明微生物種群之間的分類學關系,確認菌種的身份。
二、菌種鑒定方法
菌種鑒定一般就只要提取基因組DNA,然后PCR擴增16s rDNA片段,上機測序之后,上GeneBank或者Eztaxon對比即可。一般序列相似度在99%以上就可以認為是同一個種細菌。
三、DNA測序流程
(1)基因組DNA提取和檢測
(2)16SrDNA/18SrDNA擴增
(3)產物純化,上機測序,序列比對分析
四、菌種鑒定報告(樣本)
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